
泛基因组测序
基因组测序
基因组测序及组装是利用二代、三代及Hi-C等测序技术,利用生物信息学方法组装获得物种高质量的基因组参考序列,并对基因组进行注释。目前三代测序长读长、可轻松跨越大部分重复序列区域或杂合区域的特点使基因组组装更完整、更精确。基因组测序不仅可以获得物种的全基因组序列图谱,也为后续物种起源进化及特定环境适应性的研究奠定了基础。
单一个体的基因组不能完全代表该物种的所有遗传信息,比如小麦品种中国春的基因组序列里没有抗赤霉病基因PFT,水稻品种日本晴的基因组中缺失耐淹基因Sub1A。对单个样本或部分样本中存在的特异基因信息开展基因组序列分析即泛基因组分析,包括核心基因(Core gene)、非必须基因 (Dispensable gene) 和个体特异性基因 (Strain-specificgene),有助于充分挖掘遗传变异资源,鉴定品系特有性状调控基因。未来,泛基因组将逐渐取代单一参考基因组,成为研究动植物进化、选择与基因功能的“新标准”。
应用场景
技术优势
技术流程
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