全基因组选择育种

全基因组选择(genome-wide selection, GS)是由Meuwissen等人在2001年提出来的,是指利用覆盖全基因组的高密度分子标记对依赖于基因型、环境影响大、受微效基因控制的数量性状的预测。

随着SNP分型成本低于表现型分型成本,全基因组选择成为解决受环境影响较大、受微效基因控制的数量性状选择的最优方案。GS是目前分子育种最前沿的核心技术,拜尔-孟山都、科迪华等国际大公司已经把GS整合于商业化育种中。

 

 

技术原理

当SNP标记密度足够高的情况下,所有控制该性状的数量性状位点(QTL)与至少一个SNP标记连锁不平衡或者关联。

选择有代表的品系或个体,利用覆盖全基因组的高密度SNP标记进行分型以及性状表型鉴定,然后构建、验证预测模型。利用同一组覆盖全基因组的高密度SNP标记对新的高世代或者稳定的育种材料进行分型,然后应用验证后的预测模型计算基因组估计的育种值,选择育种值高的少数品系进行田间表型评估。

 

技术优势

 

技术流程

 

GWS预测模型应用

根据特定的种质资源或育种项目,打造个性化的全基因组选择预测模型,包括:

预测组合的杂种优势、筛选强优杂交组合;

选择优异的父母本;

利用模型设计用于构建分离群体的杂交组合。