奶牛育种自主创新联盟成立于2016年6月，“奶牛育种自主创新联盟”（以下简称“联盟”）是2016年6月首农食品集团北京奶牛中心针对我国奶牛育种产业现状，在农业农村部、北京市科委、北京市农业农村局等大力支持下，联合中国农业大学、中国奶业协会以及国内奶牛养殖、科研优势单位发起成立的。联盟成立以来，始终秉承“创新、合作、共建、共享”的理念，联合国内有区域代表性的奶养殖与种业企业、育种领域权威科研和咨询机构，聚焦奶牛育种关键短板，实施联合攻关。在自主选育芯片开发、遗传评估体系建设等方面取得多项阶段性成果，为提升我国奶牛育种自主创新能力奠定坚实基础。2020年入选农业农村部国家农业科技创新联盟标杆联盟， 2021年，联盟联合国内奶牛育种权威机构申报《北京现代种业发展三年行动计划》，率先行动落实中央一号文件关于“打好种业翻身仗”的重要指示精神。

2021年，华智生物联合首农食品集团北京奶牛中心、中国农业大学开发的我国首款奶牛自主育种高密度液相芯片初设成功，此款芯片聚焦我国奶牛种业芯片产业短板，利用国产自主可控的液相捕获二代测序技术进行开发。是我国第一款用于种子母牛群遴选和全基因组选择育种参考群体构建的高密度液相自主选育芯片，整体性能良好。有助于缩短我国奶牛育种周期，提高育种效率，进一步提升了我国奶牛育种自主创新能力。

未来，华智生物作为联盟成员，将持续借助国家分子育种平台人才与技术优势，利用自主开发的靶向测序基因型分型等先进技术，助力联盟在接下来的自主选育芯片开发、遗传评估体系建设等奶牛育种自主创新技术方面开展持续深入的工作，争取在“十四五”期间为我国打好种业翻身仗添砖加瓦。